Два больших полипептида Psa A и Psa B (81-83 кДа) составляют центральную часть комплекса фотосистемы 1, которая представляет симметричный гетеродимер; на этих белках вдоль оси симметрии размещены компоненты электрон-транспортной цепи: Р700 (первичный донор электронов), А0 (молекула Chl a), А1 (филлохинон), FX ([4Fe4S] кластер). Электрон-транспортная цепь окружена симметрично пятью С-терминальными трансмембранными α-спиралями субъединицы Psa A и пятью α-спиралями субъединицы Psa B, формирующими центральное ядро. Шесть N-терминальных трансмембранных α-спиралей Psa A и шесть α-спиралей от Psa B размещены в форме "тримера димеров" близко к центральному ядру.
Реакционный центр связан с антенной системой, состоящей из около 200 молекул Chl (в основном, Chl a), которые, в отличие от антенны ФС2, связаны с белками реакционного центра ФС1. У высших растений, кроме "коровой" антенны, имеется дополнительная светособирающая система - светособирающий комплекс I.