Psa D, совместно с Psa C и Psa E, участвует в докинге ферредоксина. Основная часть Psa D состоит из большого β-листа, образованного четырьмя антипараллельными β-тяжами, за которым следует второй 2-тяжевой β-лист. β-листы соединяет единственная α-спираль. Масса 15 кДа.